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Natürlich gibt es auch wissenschaftlichen Modellbau. Dieser findet u. a. an Universitäten und in Museen Anwendung und dient beispielsweise der Erklärung schwer verständlicher Zusammenhänge und Funktionsweisen. Die Darstellung erfolgt je nach Einsatzgebiet in verschiedenen Maßstäben. Das reicht von Verkleinerungen über Originalgrößen bis zu Vergrößerungen. Der wissenschaftliche Modellbauer wertet beispielsweise Fotos, Mikroskopaufnahmen und Präparate aus und studiert die Anatomie lebender Tiere oder Pflanzen. Daher ist er in der Lage, Modelle anzufertigen. Die Materialien sind u. a. Glas, Modelliermassen, PU-Schäume oder Kunstharzlaminate. So entstehen hochwertige Modelle meist als Einzelstücke. Diese Arbeit setzt ein umfangreiches Spezialwissen des Modellbauers voraus. Meist ist der Modellbauer mit vielen wissenschaftlichen Fachrichtungen vertraut und verfügt außerdem über handwerkliche Fähigkeiten.